ITS2条形码结合HRM分析鉴定希腊Sideritis物种

一句话概括

本文建立了基于ITS2条形码区结合高分辨率熔解曲线(HRM)分析的实时PCR方法，用于快速、封闭管鉴定希腊本土7种 Sideritis（唇形科，俗称山茶）植物，无需测序或PCR后处理。

方法针对S. scardica、S. raeseri、S. clandestina、S. perfoliata、S. euboea、S. syriaca、S. athoa共7个物种/亚种，利用Syto9染料及实时PCR荧光曲线进行分型(p.2-3)。
各物种的归一化熔解曲线、导数曲线及差异曲线均呈现独特图谱，即使Tm值相近的S. scardica与S. syriaca也可通过差异曲线清晰区分(p.3-4)。
以基因型置信度(GCP)为量化指标并设定90%阈值可准确归类各物种，S. scardica与S. syriaca相似度最高(GCP=80)，S. raeseri与S. clandestina最低(GCP=1.03)(p.5)。
ITS2序列比对及邻接法系统树验证了HRM分类结果，PCA散点图进一步支持树状分组，累计解释81.29%的总变异(p.5-6)。
该Bar-HRM方法具有低成本、高灵敏度、无污染风险及无需后续处理的优势，可推广应用于其他药用植物的真伪鉴定和育种保育工作(p.1,6-8)。（据课件，未经核实）

中文	原文
内转录间隔区2	ITS2 (Internal Transcribed Spacer 2)
高分辨率熔解曲线分析	HRM (High Resolution Melting)
条形码-HRM联合分析	Bar-HRM
基因型置信度	GCP (Genotype Confidence Percentage)
熔解温度	Tm (melting temperature)